DÉCRYPTAGE - Depuis juin 2021, l'Organisation mondiale de la santé (OMS) utilise des lettres grecques pour désigner les principales lignées du Covid-19. Or ce n'est pas le cas pour les derniers variants en circulation.
, mis en place en 2020 par un groupe de chercheurs britanniques et utilisé par les scientifiques avant même que les lettres grecques ne soient employées pour le Covid.
«Le principe fondamental, c'est que les noms des lignées représentent l'ascendance et la descendance»Oliver Pybus, biologiste spécialiste de l'évolution à l'université d'Oxford, qui a participé à la conception de Pango. Ce dernier peut être lu comme un arbre généalogique du Covid-19. Chaque branche correspond à une lignée. «justifie Florence Débarre.
Les lignées Pango fonctionnent avec une lettre, suivie de chiffres. Un point sépare les lettres des chiffres et les chiffres entre eux. Originellement, il existait deux grandes lignées du Covid-19, nommées «A» et «B». Seuls des variants issus de la lignée «B» circulent aujourd'hui. Ainsi, «B.1» descend de «B». «B.1.1.1» est, lui, issu de «B.1.1», qui provient lui-même de «B.1».
Le X de «XBB» est utilisé pour désigner les recombinants, ces variants issus de la combinaison de deux souches comme «XBB.1.5». «XBB.1.5» est donc issu de la lignée de «XBB.1», mais «explique Florence Débarre. De la même manière, une nouvelle lignée apparaît lorsque plusieurs mutations surviennent, ou lorsqu'une mutation unique est suffisamment importante.
Si le virus change complètement, la première lettre peut aussi changer. Le variant gamma, détecté pour la première fois au Brésil, s'appelait ainsi P.1, alors qu'il descendait de «B.1.1.28» et que son nom aurait donc pu être «B.1.1.28.1».Ce système Pango sert de langage commun à tous les scientifiques.
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